Moisekatsi (Mooste) ümbruse taludes kuulutasid evangeeliumi alates 1901 Jaan Paidrasson jt. Usule tulnud ja ristitud inimesed liitusid Tartu II Baptisti Kogudusega.

Jaanimõisa palvela valmis 1929, aasta hiljem kogudus iseseisvus.

Me kuulume Eesti Evangeeliumi Kristlaste ja Baptistide Koguduste Liitu, mis ühendab 86 kogudust kokku üle 6500 täiskasvanud liikmega. Liit on moodustatud koguduste abistamiseks töötegijate ettevalmistamisel, suurürituste korraldamiseks ning koostööks teiste kirikute ja Eesti riigiga.

Ajalooliselt moodustati EKB Liit peale Teist maailmasõda neljast usuliikumisest: baptistid, evangeeliumi kristlased, priilased ja nelipühilased.

Kogudusevanematena on töötanud:
Peeter Lode 1931-1939

Johannes Traks 1939-1953

Paldor Teekel 1953-1956, 1959-1965

Karl Tootsi 1956-1959

Feliks Viira 1965-1974, 1999-2000

Daniel Luik 1975-1998

Tarmo Õun 2000-2003

Ermo Jürma 2004-st.